（甲狀腺、副甲狀腺、腦下垂體、腎上腺、 胰臟的胰島腺等）
內分泌系器官是大家一般所說的分泌「荷爾蒙」的器官。什麼叫做「荷爾蒙」呢？人體要維持生命總需要一個指揮系統，就是神經系統，身體的各器官組織受到神經組織的作用來控制其整個生理活動。此外，身體的各器官組織也會受到另外一種化學物質的影響控制其生理活動，而這一種物質又不是各器官本身所產生的，而是由本身以外的器官生成分泌後，經過血液的流動帶來的，這一種化學物質叫做「荷爾蒙」也叫做「激素」。而分泌「荷爾蒙」的組織器官，因沒有管道引流其分泌物質出來，而是經由血液的流動被帶到其他器官組織後對其器官組織的細胞發揮其作用，因此就叫做「內分泌腺」。而與內分泌腺相對的器官叫做「外分泌腺」，這一種腺體則有導管把所分泌出來的化學物質引流到消化管或氣管道管腔等會通到體外的管腔或體表以執行各分泌物的生理作用或做排 泄之用。如消化管內的消化腺（分泌各種幫助消化的消化酵素），唾液腺，汗腺等就 是。
甲狀腺、腦下垂體、腎上腺或性腺等分泌出來的分泌物就是屬於內分泌物，也就是一 般所說的「荷爾蒙」。因為一般觀念上都把「荷爾蒙」一詞跟「性腺的內分泌物質」 劃上等號，所以都以為「荷爾蒙」就是指「性腺」所分泌的物質而與性有關係，其實 「性腺內分泌物質」不過是內分泌物質的一種而已。
內分泌腺中我們比較熟習的是甲狀腺，其他還有腦下垂體、副甲狀腺、腎上腺、男女 性腺等。除了這些外還有胰臟中的胰島腺所分泌的胰島素則與血糖的調節有關（因與 新陳代謝有關，有時候分類為新陳代謝有關系統，有時候也把內分泌系統與新陳代謝 系統放在一起處理），而分泌各種消化酵素的分泌腺則都是屬於外分泌腺器官。
腦下垂體、甲狀腺、腎上腺、性腺等都是各自獨立的器官，但在生理作用上，從腦下 垂體開始一個個依序影響控制下來，因此可以說互相有緊密的連帶關係。因此下游器官疾病的症狀表現常常是上流器官的疾病一直影響下來的，因此有可能是最上游器官 所發生的毛病的症狀。
除了甲狀腺的疾病較常見而較有特徵性的症狀，因此為健康檢查的目標疾病之一種外，其他腦下垂體、腎上腺及性腺的疾病則不是症狀不太明顯而不容易發現或反過來則因為症狀太過於明顯而未做健康檢查 之前就會就醫診查，因此平常不是健康檢查的對 象疾病。如巨人症，末梢肥大症等就在平常就有明顯的症狀而不會等到健康檢查來查 出，早就求醫診治了。
